YEPAF Araştırma Grubu bünyesinde yer alan yetkin akademik ve teknik kadro, Yüksek Enerji Fiziği, Parçacık Fiziği, Parçacık Algıçları, Parçacık Hızlandırıcıları ve benzeri konularda Ar-Ge çalışmaları yürütmektedir. 

YEPAF Ar-Ge çalışmaları için oluşturulmuş olan laboratuvar alt yapısı, hali hazırda yürütülen çeşitli dış kaynaklı (TÜBİTAK, TENMAK, TÜSEB) araştırma projeleri ve uluslararası işbirlikleri çerçevesinde gerçekleştirilen ileri fizik araştırmaları doktora öğrencilerinin kazanacakları yetkinlikler için de büyük bir imkan yaratmaktadır. 

İstinye Üniversitesi, Avrupa Parçacık Fiziği Laboratuvarı CERN’de yürütülen beş (ATLAS, CAST, DRD1, DRD Calo, FCC), Çin Bilimler Akademisi Yüksek Enerji Fiziği Enstitüsünde yürütülen bir (BESIII) ve ABD Brookhaven Ulusal laboratuvarında tasarlanan bir (sr-EDM) deneysel işbirliği ile CosmicWISPers adlı COST aksiyonuna dahildir.

K-Modülasyonu Yöntemiyle Parçacık Hızlandırıcısı Demet Hattındaki Ortalama Manyetik Alanın Ölçümü (2023-2026) / TÜBİTAK (1001)

Kozmik Nötron Tespiti İçin Sintilasyon Tozları ve Optik Ortamların Potansiyelinin Araştırılması (2024-2027) / TÜBİTAK (1001)

MeV Enerjili Elektron Hızlandırıcısı Tasarım Yazılımı  (2023-2026) / TÜBİTAK (1001)

Antarktika'da Kozmik Müon Akısı Ölçümü ve Güneş Aktivitelerinin Kozmik Müon Akısı Üzerinde Etkilerinin Araştırılması (2025-2027) / TÜBİTAK (Kutup-1001)

Aktif Zırhlamalı Gama Sondası Geliştirilmesi (2021-2023) / TÜBİTAK (1005)

Lityum Tetraborate Nanoparçacık Katkılı Plastik Parıldak Üretimi ve Karakterizasyonu (2024-2026) / TÜBİTAK (1005)

Yerel bir DAQ ve DCS Sisteminin IoT entegrasyonuyla tasarım ve Geliştirmesi (2025-2026) / TÜBİTAK (1005)

Geniş Alanlarda Toprak Nem Miktarını Ölçen Yeni Bir Kozmik Işın Nötron Sensörü Üretimi (2022-2023) / TÜBİTAK (1512)

Gaz Tipli Parçacık Algıçlarında Kullanılan Gazlar İçin Ekolojik İyileştirme (2024-2025) / TÜBİTAK (1002)

Parçacık hızlandırıcılarında dört kutuplu mıknatısların makine öğrenmesi desteğiyle hizalanması (2025-2026) / TÜBİTAK (1002)

Sayım ve emisyon yönü algılama fonksiyonlarının entegrasyonuyla yeni nesil hibrit gama sondası geliştirilmesi (2024-2026) / TÜSEB (B)

Diş Pulpasının Sağlığının Ölçümüne Yönelik Tek Taraflı Nükleer Manyetik Rezonans Cihazının Geliştirilmesi (2025-2027) / TÜSEB (B)

CERN-ATLAS Deneyinde Veri Alımı, Veri Analizi ve Algıç Sistemlerinin İşletim, Bakım ve Yükseltme Çalışmaları (2021-2024; 2025-2028) / TENMAK (CERN)

Sanal Fizik Dersi Laboratuvarı Uygulamaları (Anadolu Ü.; 2024-2026) / Erasmus+ KA220-SCH 

Cosmic WISPers in the Dark Universe (Bari Ü., Italya; 2022-2026) / COST Action CA21106 

Taşınabilir Yeni Nesil Tıbbi Görüntüleme Sistemi Geliştirilmesi (Niğde Ömer Halis Demir Ü.; 2021-2025) / TÜBİTAK (1001)

Gadolinyum Katkılı Su Çerenkov Dedektörü ile Nötron Etkileşim Modelinin Geliştirilmesi (Erciyes Ü.; 2022-2025) / TÜBİTAK (1001)

Parçacık Hızlandırıcı ve Algıçlarında Özel Parıldak Üretimi (Boğaziçi Ü.; 2022-2024) / TÜBİTAK (1005)

Ülser tespiti için polimer bazlı fiber optik sensör sisteminin geliştirilmesi (Karamanoğlu Mehmetbey Ü.; 2023-2025) / TÜSEB (B)

CERN’deki CMS Deneyi’nde Jet Fiziği Analizleri ve HCAL- HGCAL Dedektör Ar-Ge Çalışmaları (Yıldız Teknik Ü.; 2024-2027) / TENMAK (CERN)