İstinye Üniversitesi Eczacılık Fakültesi, ilk olarak 2017–2018 Eğitim-Öğretim Yılı Güz Dönemi’nde Türkçe Eczacılık Programı ile eğitim-öğretim faaliyetlerine başlamış ve ilk öğrencilerini kabul etmiştir. Artan uluslararasılaşma hedefleri doğrultusunda, 2018–2019 Eğitim-Öğretim Yılı Güz Dönemi’nde İngilizce Eczacılık Programı açılarak öğrenci kabulüne başlanmıştır.
Fakültemiz, Türkçe Programındaki ilk mezunlarını 2021–2022 Eğitim-Öğretim Yılı Bahar Dönemi’nde, İngilizce Programındaki ilk mezunlarını ise 2022–2023 Eğitim-Öğretim Yılı Bahar Dönemi’nde vermiştir.
Eğitim, araştırma ve topluma hizmet faaliyetlerini sürekli geliştiren Fakültemiz, 2023–2024 Eğitim-Öğretim Yılı Güz Dönemi itibarıyla Vadi İstanbul Ana Yerleşkesi’ne taşınarak modern binada, kütüphanesi, derslikleri, öğrenci laboratuvarları ve araştırma altyapısıyla faaliyetlerine devam etmektedir.
